Monchique é um topónimo composto, proveniente do lat. Monte Sacru 'Montanha Sagrada'. As atestações árabes conhecidas Munt Šáqir, Munt Šáq.r, Muntašáqur, Muntišáq.r documentam os seguintes processos de variação e mudança: palatalização da sibilante apicoalveolar latina e metátese da vibrante alveolar simples para posição de coda (comum a todas elas), formas sem e com aglutinação dos dois componentes (Munt Šáqir, Munt Šáq.r / Muntašáqur, Muntišáq.r) e variação do timbre das vogais átonas (Munta /munti; Šáqir / šáqur) ou mesmo a sua perda no primeiro elemento da composição (Munt). É essa perda e a aglutinação do nome ao adjetivo que levarão à reanálise da consoante dental e da apicoalveolar (esta última já pronunciada em árabe como uma palatoalveolar) como uma africada palatal surda em posição de ataque. A variante Munchice (/mõˈʧike/), que figura na Relação da Derrota Naval em 1189, atesta não só essa reanálise, através do dígrafo <ch> que representa a africada, como as soluções históricas vocálicas que viriam a prevalecer, nomeadamente a palatalização da vogal tónica /á > í/ (imāla) e o emudecimento da vogal átona final /u > i ~ e/ (~ = em variação com).

Enquanto produto do contacto linguístico entre o árabe andalusi e o moçárabe, as soluções históricas documentadas por este topónimo decorrem dos seguintes mecanismos de mudança: (i) nivelação linguística, testemunhada pelo emudecimento e perda da vogal final do acusativo singular, variantes romances reforçadas pela sua pronúncia em árabe; (ii) mistura linguística, produzida pelas palatalizações da sibilante apicoalveolar e da vogal tónica, próprias do árabe andalusi; (iii) inovação linguística, mediante a metátese e posterior apócope da vibrante, a aglutinação dos dois termos da composição e a reanálise das consoantes dental e palatoalveolar surdas como uma africada palatal em posição inicial de sílaba, fonema integrante do inventário fonológico do moçárabe. A simplificação da africada palatal surda /ʧ > ʃ/ é já uma mudança portuguesa tardia (/mõˈʃik(e)/).

A motivação do étimo encontra-se na sacralidade das Caldas de Monchique (associadas a um culto pré-romano) e na do próprio território de que fez parte, conhecido na antiguidade como Promontorium Sacrum.