El topónimo palentino tiene el enorme interés de ser una muestra bien documentada de los muchos topónimos castellanos que muestran una forma Cubilla para la que se podrían proponer varias explicaciones. En este caso al menos, y probablemente esto es extensible a todos los topónimos iguales, gracias a la documentación antigua a nuestra disposición podemos proponer que estamos ante una forma diminutiva del común castellano cueva, de origen latino. Se ha producido ciertamente el cierre de /o/ en /u/ y la grafía con <B> está extendida (aunque hay casos de <V>), dificultando la visibilidad del étimo, pero ello son inconvenientes menores. Particularmente el paso de /o/ a /u/ se explica fácilmente por un cierre de la vocal pretónica que se asimila a la sílaba tónica, probablemente cuando esta aún mantenía el diptongo procedente de /e/ latina tónica.. Se da en otros muchos casos seguros. Así pues, "cuevecillas" parece un significado más que conveniente. El segundo elemento, "de Cerrato" hace alusión a la conocida comarca en la que se encuentra. Se ha añadido, precisamente, y desde antiguo, porque el término Cubillas es frecuente.