Tal y como se ha señalado en algún topónimo emparentado tratado en esta obra melgar es un sustantivo de significado colectivo-abundancial que figura como tal incluso ahora en el DRAE, pues un melgar es un "campo abundante en mielgas", siendo mielga una planta herbácea anual de la familia de la papilionáceas, semejante a la alfalfa. La palabra es de origen latino, como el propio sufijo que indica este valor abundancial-colectivo. Se ha señalado también la posibilidad, siempre con este valor colectivo-abundancial, de que en casos como el de este topónimo se trate no de un derivado de mielga, sino de otra voz castellana tan semejante a esta como amelga. Esta voz designa una "faja de terreno que el labrador señala en la haza para esparcir la simiente con igualdad", según definición del DRAE reproducida en DCECH s.v. La palabra es de origen desconocido, aparentemente no latino, por lo que se propone un origen celta. La palabra tiene o tuvo muchas variantes dialectales del tipo melga, belga, embelga, etc., por lo que sería totalmente posible que de una variante con aféresis de /a/ surgiera el colectivo en -ar presente en Melgar. No es fácil decidirse entre ambas posibilidades, pero en principio parece más verosímil que se trate de la primera palabra, esto es, que estemos ante un colectivo fitonímico, pues el sufijo es muy frecuente en este campo léxico. 

Véase, con todo, que el lugar ha recibido distintos segundos elementos a lo largo de su historia.