El nombre Segŏntia, verosímilmente de significado "ciudad victoriosa", es la adaptación latina de un nombre prerromano, muy probablemente  procedente del celta en su raíz, Sego- (RohlfsAspectostoponimia, 242) e infijo,-nt-. Siguiendo las leyes usuales de la fonética castellana, se transformó en el actual Sigüenza. El cierre de la vocal inicial /e/ en /i/ se debe a metafonía o armonía vocálica por asimilación a la vocal cerrada de la sílaba siguiente una vez que se ha producido la diptongación de /ŏ/,  esto es, *següenza > sigüenza.