Coromines (1972: 266, nota 27) cree que el topónimo tiene origen celta o sorotapto: «quizá una *Kallipendion, compuesto kal(l)io- 'piedra' [...] y pend- de quend- 'fragmento' (arapendis en galo) importante por ser un nombre dado por celtas de P = QU; tal vez más bien *kalipendion (con ll por etimología popular) pues es Garipenzu en vasco (Campión, Zigor I, II, 11)».

Como decíamos en un trabajo de hace unos años (Salaberri, 2010: 354), de una forma *Kallipendion no podría haber salido Galipentzu (y menos aún Garipentzu), sino algo como *Galipendio (o tal vez *Galipendioe, *Galipendioi añadiríamos ahora; compárese con Mondragón > Mondragoe, Mondragoi...). Ciertamente es un topónimo oscuro, y la explicación más sencilla sería ver una base desconocida *kaLipen, *gaLipen o *kalipen, *galipen, tal vez un fitónimo (cfr. Aritzu, Elosu, Urkizu con haritz 'roble', elorri 'espino albar', urki 'abedul'...) o un nombre relacionado con el significado 'tierra' o similar (cfr. Loizu, con lohi 'barro') y el sufijo abundancial -zu que tenemos por ejemplo en mukizu 'mocoso', zorrizu 'piojoso', etc.

De todos modos, el euskera antiguo no tenía p (FHV, 261) y habría que pensar que en el étimo había un grupo de consonantes sonoras: cfr. cobdiçia (castellano antiguo) y gutizia (euskera) o Abaiz (variante empleada en romance) / Epai(t)z, denominación vasca de un pequeño despoblado situado entre Lerga y Ujué / Uxue (cfr. latín abbas; véase FHV, 65, 229 y Salaberri, 1994: 171, 227). Pero no sabríamos decir cuál es el grupo en cuestión.

Otra posibilidad es considerar que en la segunda parte del topónimo tenemos un préstamo del latín, lo mismo que en Gelbentzu, nombre de otra localidad navarra (Odieta), con un posible segundo elemento *bentzu que muestra bilabial sonora, habitual en euskera tras sonante. Ambas localidades están en cuesta (más Gallipienzo / Galipentzu que Gelbentzu) y por ello podríamos pensar en el participio pēnsu(m) del latín pendeō 'être pendu, suspendu' (Ernout y Meillet, 1994: 494-496), que haría referencia a la situación en cuesta de ambas localidades.

Para el primer elemento es posible ver una forma antigua de gari 'trigo', que en composición ha perdurado como gal- (en galburu 'espiga de trigo', con buru 'cabeza', 'cabezo'), pero entonces habría que pensar que dicha forma antigua tenía una lateral lenis (*gali) que, en posición intervocálica, se habría convertido en tap, como es habitual en euskera (cfr. latín gula > vasco gura 'deseo'; véase EHHE, p. 244-245).

Si se aceptara, no habría dificultad para explicar la variante vasca Garipen(t)zu de Murillo el Fruto (c. 1400; véase Salaberri, 2015: 415-417), y tampoco la romance Galipienzo empleada todavía en Ujué / Uxue, y bien documentada. La forma oficial Gallipienzo se debería a la acción de la vocal palatal, de modo similar a lo que ocurre en Ullíbarri, forma castellana de más de una localidad llamada en euskera Uribarri. El problema sería entonces explicar la variante Galipentzu empleada en los valles pirenaicos y también in situ, según el testimonio de 1730 y la microtoponimia eusquérica del valle de Aibar / Oibar. La forma Gel- de Gelbentzu podría ser fruto de la asimilación vocálica a partir de Galben(t)zu (Gualvençu en 1280), pero esto dista mucho se ser seguro, ya que es el único testimonio con a que conocemos, y no es el más antiguo.

Si lo dicho tuviera algún viso de realidad, Galipentzu y Gelbentzu serían en origen algo así como 'la cuesta del trigo', ' la pendiente en la que hay trigo'.

Sea como fuera, está claro que la variante vasca es anterior a la romance o castellana, fruto esta última de la diptongación de la e tónica y apertura de la -u final en -o, procesos ambos que no tienen por qué ser muy antiguos. Cfr. Arbulu (eus.) > Arbulo (cas.) (A), Betoñu (eus.) > Betoño (cas.) (A), Errezu (eus.) > Riezu (romance) (N), Ledena > Ledea (eus.) / Liédena (romance) (N), Zuhatzu (eus.) > Zuazo (cas.) (A), etc. (véanse Mitxelena, 1956: 170-171 y Salaberri, 2016: 401 y 408).