A propósito del origen del topónimo, Caro Baroja (1945: 75) solo dice que hay que ponerlo en relación con Nuin, nombre de una localidad de Juslapeña / Txulapain (N), pero no da más explicaciones. Por su parte, Belasko (1999: 324) escribe lo siguiente: «Probablemente 'lugar propiedad de una persona llamada *No-'. De *no- + -ain, siendo el primer elemento un nombre de persona no identificado y el segundo un sufijo que indica propiedad».

En nuestra opinión (vése Salaberri y Salaberri, 2023: 491-492) la relación entre Nuin y Noain es muy dudosa, vistas las variantes documentales de ambos topónimos, y en cuanto a Noain, creemos que una vía explicativa podría ser ponerlo en relación con Nonus 'noveno hijo', 'hijo nacido en noveno lugar' (Salomies, 1987: 111).

Sin embargo, en el mencionado trabajo añadíamos que, teniendo en cuenta que en la documentación medieval el nombre personal Nunu, Nuno, escrito de varias maneras pero con segunda nasal fortis (Nunnu, Nunno) o palatalizada (Nunnio, probablemente lo que ahora escribiríamos Nuño) es bien conocido, nos parecía más adecuado pensar que el sufijo ya independiente -ain (procede del genitivo -ani del sufijo latino -anu) se añadió directamente a la forma eusquérica del nombre personal mencionado, a NuNo (existieron también los hipocorísticos Nunuso, Nonuso y Nunutto, Salaberri, 2009: 189 y 203). El resultado sería una formación del tipo de *NuNoain, de la cual, por asimilación vocálica, habría salido *NoNoain y luego, por haplología, Noain.

En «territorio de Castella», es decir, en Castilla, encontramos en 1029 «...in vila de Nonno» (Ubieto, 1962: 146), en un documento –escrito en latín– en el que aparece también un tal Nunnu Gundesalbeç (ibid., p. 147).