Se trata de un topónimo de extraordinaria dificultad. Esta dificultad emana principalmente de que disponemos desde antiguo de una sola forma, igual a la actual, siendo las variantes tan solo variantes gráficas, no fonético-morfológicas, y de que el topónimo, a nuestro conocimiento, está casi totalmente aislado. Se ha hallado, consultando por todo el territorio español, algunos escasos paralelos que podrían mostrar la existencia de un sustantivo batre, vatre (véase más abajo el apartado "cognados"), pero parece que estos topónimos deben de tener otro origen o bien ser, en algún otro caso, traslado del topónimo madrileño por su aplicación antroponímica.
Así las cosas, y solo a título de posibilidad, cabría considerar la posibilidad de ver en este topónimo un nombre personal, de propietario, a partir del sustantivo latino PATER, PATRIS, "padre", en caso genitivo,  PATRIS, "de Padre". La utilización de este sustantivo como antropónimo, como nombre personal, está bien documentada y cuenta con paralelos claros, aunque escasos, en territorio castellano, como es el caso de Torrepadre.  La sonorización de /p/ en /b/ y el mantenimiento de la /t/ sin sonorizar podría ser atribuido su presencia en territorio con evolución fonética mozárabe o bien al influjo del árabe. Hay paralelos claros de todo ello en topónimos del mismo grupo etimológico, como Baterno, en Cáceres, procedente del latín PATERNUS, también antropónimo. El topónimo, de esta manera, significaría en origen "de Padre", estando elidido, como tantas otras veces, un sustantivo, que podría ser "villa", "torre", "campo" o similar. 

Esta hipótesis debe ser considerada muy provisional, a la espera de nuevos datos que la corroboren o bien apunten en otra dirección.