El topónimo tiene el gran interés de mostrar un derivado mediante el sufijo -ato, -ata del sustantivo común castellano nava, hoy desusado, pero de gran vigor en otros tiempos, a juzgar por su abundante presencia toponímica en una zona muy amplia de España. Puede verse un estudio breve, pero completo a la vez, sobre su origen en el apartado correspondiente. El significado que recoge el DRAE para el sustantivo es el de "tierra sin árboles y llana, a veces pantanosa, situada generalmente entre montañas" es considerablemente vago, como no podía ser de otra manera y no es muy aplicable en el caso concreto del topónimo madrileño. Se encuentra, hasta donde podemos percibir, en un terreno que no está entre montañas y que es muy boscoso. El sufijo añadido es el mismo que hallamos en otros topónimos del tipo Cerrato. Es discutible su significado, pero lo más verosímil es considerar que tiene algún tipo de valor diminutivo-afectivo. Así pues, La Navata parece significar "nava pequeña", con la imprecisión que, señalamos, tiene para nosotros el significado del sustantivo nava.