Al igual que se ha señalado en el topónimo hermano Piñel de Arriba, dado el aspecto del topónimo y la documentación antigua a nuestra disposición cabrían, en principio, dos posibilidades. Una primera, menos verosímil, sería una aproximación a la palabra peña, como la cercana población de Peñafiel; la segunda sería ver por el contrario una forma de diminutivo de pìno, con diptongación usual del sufijo latino -ĔLLU en -iello y apócope posterior de /o/ final antes de que se produjese la usual monoptongación posterior del diptongo. Así pues quizá se trate sencillamente de pinello > piniello > piniel. La documentación más antigua a nuestra disposición (véase Piñel de Arriba) muestra, en efecto, una forma Piniello.  Además, la forma piniel está documentada y de ella procedería fácilmente Piñel como resultado de la palatalización de /n/ en grupo [nj], justamente como sucedió precisamente en piña <pinia >pinea. La apócope a la que se ha hecho mención suele atribuirse a un ambiente mozárabe, pero estrictamente hablando ello no es necesario. Puede compararse casos como Montiel, Carabanchel, Serradiel (Albacete), etc. El diminutivo de pino por añadidura podría ser aquí efectivamente un diminutivo de un fitónimo, pero también podría haberse dado con el significado secundario que se halla en el adjetivo castellano "pino", esto es, "empinado", "en cuesta". Tratándose de Piñel de Arriba un significado así es sumamemente plausible y la presencia del nombre en Piñel de Abajo sería fácilmente atribuible a un traslado posterior. Así pues, incluso con este étimo caben dos posibilidades, o fitónimo o referencia a la cuesta que lleva a Piñel de Arriba.

En lo que hace al segundo elemento, nótese la sustitución, en torno a los siglos XV y XVI del antiguo adverbio (a)yuso por abajo como en tantos otros casos de la toponimia española.