La pronunciación llana —/alxámbra/— del topónimo demuestra que se remonta al árabe andalusí al-ḥámra y no al clásico al-ḥamrā', que se habría acentuado */alxambrá/. Por otra parte, a diferencia de los topónimos La Alhambra (Granada) y Alhambra (Ciudad Real), la antigua H aspirada castellana, derivada de la Ḥ árabe, no dejó de pronunciarse cuando la h castellana enmudeció, sino que se transformó en jota. A partir del siglo XVII la H aspirada castellana desaparecía en el norte, pero en el sur se conservó durante más tiempo (incluso hasta hoy en algunas zonas de Andalucía, donde se representa con J: cante jondo, jambre). Cuando la jota castellana se creó en el siglo XVI, convivió con la H aspirada en las zonas donde esta se mantuvo viva durante más tiempo y, debido a la semejanza de los dos sonidos, algunas H aspiradas castellanas se reinterpretaron como jotas, lo que explica la grafía actual Aljambra.