Na primeira fase do proxecto coordinado Toponomasticon Hispaniae (2021-2025), o subproxecto Toponimia do País Vasco e Navarra levou a cabo o estudo de 967 formas toponímicas dos dous territorios que comprende, considerando as fichas dos topónimos, dos étimos e os cognados, practicamente todas xa dispoñibles na aplicación para consulta libre. Son fundamentalmente macrotopónimos, xunto a algúns corónimos, orónimos e hidrónimos. 

Continúase agora coa elaboración de fichas toponímicas e etimológicas, prestando especial atención a dous aspectos: por unha banda, á prolongación antroponímica, é dicir, aos apelidos (e mesmo nomes persoais) aos que deron lugar determinados topónimos; doutra banda, á proxección americana: como a toponimia vasca e navarra reflíctese en América. 

Nesta nova fase (2026-2029), o equipo Toponimia de Aragón, Cantabria y La Rioja está encardinado dentro do subproyecto  Toponimia centropeninsular e insular atlántica, o cal abarca unha zona amplísima, que comprende Aragón, Cantabria, A Rioxa, Navarra, País Vasco, a maior parte de Castela e León e de Castela-A Mancha, Madrid, Estremadura, Andalucía e as illas Canarias.